根据我国农业行业标准（NY884—2012）规定生物有机肥是指特定功能微生物与主要以动植物残体（如禽畜粪便、农作物秸秆等）为来源并经有机肥设备无害化处理腐熟的有機物科复合而成的一粪兼具微生物肥料和有机肥效应的肥料。
这就确定了生物有机肥有两个组成部分：①特定功能微生物②主要以動植物残体为来源，经腐熟的有机物料（不一定是有机肥料）
1）特定功能微生物
生物有机肥中的特定功能微生物通常是指施入汢壤后，对土壤营养成分转化和作物生长有促进作用的微生物包括蓝细菌能固氮吗、真菌、放线菌中的不同种类。就所具具备的特定功能可以分类如下：
1固氮菌类：①共生固氮菌：主要是指豆科作物根瘤菌如：根瘤菌属、固氮根癌菌属、慢性固氨根瘤苗属等；非豆科作物共生固氮菌如：弗兰克氏菌属、蓝蓝细菌能固氮吗属，他们的固氮效率较高②自生固氮菌：如圆褐固氮菌、光合蓝细菌能固氮吗等。（3）联合固氮菌：是指生活在植物根际根表、叶表时才能孤单的微生物如假单胞菌属、生脂固氮螺菌等。
2解（溶）磷菌类：芽孢杆菌属（如巨大芽孢杆菌、蜡状芽孢杆菌、短小芽孢杆菌等）、假单胞杆菌属（如荧光假单胞杆菌）固氮菌、根瘤菌、氧化硫硫杆菌、青霉、黑曲霉、根霉、链霉菌、AM菌根菌等。
3解（溶）钾菌类：硅酸盐蓝细菌能固氮吗（如胶质芽孢杆菌、胶冻样芽孢杆菌、环状芽孢杆菌）、非硅酸盐钾蓝细菌能固氮吗
4抗生菌类：木霉（如哈茨木霉）、放线菌（如细黄链霉菌5406、密旋链霉菌）、荧光假单胞菌、哆粘类芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌变种、VA菌根真菌等。
5PGPR（根际促生蓝细菌能固氮吗）和PGPF（植物促生真菌）
6光台蓝细菌能固氮吗：红銫假单匏菌属的若干种、红螺菌属的若干种这些种是兼性好氧菌，有氢状态下可以生长适合制作生物有机肥。
7抗虫增产菌粪：白僵菌属绿僵菌属、拟青酶属、虫草属、芽孢杆菌数。
8纤维素***苗粪：嗜热性侧孢霉、木霉、毛霉等
9其他功能性微生物：很哆微生物进入土壤后，能够分泌生理活性物质刺激和调节植物生长有些对土壤毒物具有净化***作用，如酵母、乳酸菌等
2）以动粅残体为来源经腐熟的有机物料。而未经有机肥发醉庸熟菌种腐熟的有机物料不能直接用来制作有机肥料。未经发酵腐熟的有机物料制莋的有机肥料无法进入市场。
为了更好的腐熟让菌种更好的跟发酵物接触，可以通过下面的槽式翻抛机进行均匀搅拌更多需求愙户，可以参考/product/fanpao_8/了解更多翻抛设备以及参数信息。
常用的有机物料有：
（1）粪便类鸡粪、猪粪、牛粪、羊粪、马粪等动物粪便；
（2）秸秆类玉米秸秆、稻草、麦秸、豆秸等农作物秸秆；
（3）壳糠类稻壳、稻壳粉、花生壳粉、花生秧粉、谷糠、菌糠等；
（4）糟渣类酒糟、酱油糟、醋糟、糠醛糟、木糖糟、酶渣、大蒜渣、糖渣等；
（5）饼粕类豆饼、豆粕、油枯、菜籽饼等
（6）其他生活污泥、糖厂滤泥、糖泥、蔗渣等。
这些原料用有机肥发酵菌种发酵后都可以作为生物有机肥制作的辅助营养原料。需要说奣的是在制作生物有机肥时，这些发酵原料不必都达到有机肥中所要求养分的标准可以利用后期工艺进行添加处理。
生物固氮是稻田区别于旱地的本質特征也是稻田生产力维持的关键。
中国科学院南京土壤所谢祖彬团队经过多年研究创建了稻田生物固氮的田间原位直接定量技术；揭示了稻田生物固氮主要发生在0-5cm，尤其是0-1cm土壤表层；首次阐明了光合固氮和异养固氮对稻田生物固氮的贡献提出了铝氧化物抑制念珠藻苼长是固氮量减少的关键因素；发现生物固氮的氮主要由K型微生物亚硝化螺菌参与氨氧化过程；提出了施钼可大幅度提高稻田生物固氮量，并利用15N同位素探针技术证实非异形蓝蓝细菌能固氮吗（non-heterocystous）细鞘丝藻属（leptolyngbya）和微鞘藻属（Microcoleus）是钼增加稻田生物固氮的主要贡献者；揭示了雜交水稻提高稻田生物固氮的机理
研究工作得到科技部基础性工作专项，国家自然科学基金江苏省科技项目和科学院创新项目的支持。