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中药DNA条形码鉴定中的DNA提取方法研究
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中药DNA条形码鉴定中的DNA提取方法研究
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对一些DNA提取方法的总节(欢迎大家补充讨论)
有时候提DNA不是很顺,所以提出来大家讨论一下,因为我是做微生物的,我首先提供一下关于微生物的DNA 提取方法,大家觉的有可以改进的地方,欢迎讨论!!
细菌DNA的提取:
1. 抽提缓冲液
2% CTAB (W/V)
2% PVP K25 (w/v) (去色素)
100mM Tris-HCl (pH8.0)
25mM EDTA (pH8.0)
2.10M LiCl
3. 2M LiCl
4.DEPC-water(抑制RNA酶活性)
5. 3M NaAc (pH5.2)
6. 96% 乙醇
7. 70% 乙醇
1.抽提缓冲液65℃预热;
2. 加菌体到已经预热的缓冲液(700ul)中混匀,65℃,10min;
3. 加酚/氯仿/异戊醇(25:24:1),振荡,离心12,000rpm,10min;
4.取上清,加氯仿/异戊醇(24:1)振荡,离心12,000rpm,10min;
5. 取上清,重复4步骤;
6. 加入1/10体积的3M醋酸钠和1.5倍体积的乙醇(或加入等体积的异丙醇),-20C沉淀;
11. 离心12,000rpm,10min;
12. 弃上清,70%乙醇洗,也可以再用100%乙醇洗,然后溶解于100ml 水中。
(二)(我们常用的方法,但是有时有些细菌特别不好提,就用上面的方法)
1. 将菌株接种于液体LB培养基,37℃震荡培养过夜。
2. 取1.5ml培养物12000rpm离心2min。
3. 沉淀物加入567 ul的TE缓冲液,反复吹打使之重新悬浮,加入30ul 10%SDS和15ul的蛋白酶K,混匀,于37℃温育1h.
4. 加入100ul 5mol/L NaCl, 充分混匀,再加入80ul CTAB/NaCl溶液,混匀后再65℃温育10min。
5. 加入等体积的酚/氯仿/异戊醇混匀,离心4-5min, 将上清转入一只新管中,加入0.6-0.8倍体积的异丙醇,轻轻混合直到DNA沉淀下来,沉淀可稍加离心。
6. 沉淀用1ml的70%乙醇洗涤后,离心弃乙醇.
真菌DNA的提取:
1.取真菌菌丝0.5g, 在液氮中迅速研磨成粉
2.加入4mL提取液,快速振荡混匀
3.加入等体积的4mL的氯仿:异戊醇(24:1),涡旋3~5min(此处是粗提没有加酚,可以节约成本的哟!)
4.1000rpm,4℃,5min
5.上清用体积的氯仿:异戊醇(24:1)再抽提一次(10,000 rpm,4℃离心5 min)
6.取上清,加入2/3倍体积的-20℃预冷异丙醇或2.5倍体积的无水乙醇沉淀, 混匀, 静置约30 min
7.用毛细玻棒挑出絮状沉淀, 用75%乙醇反复漂洗数次, 再用无水乙醇漂洗1次, 吹干,重悬于500 ulTE中
8.加入1 ul RNaseA (10 mg/mL),37℃处理1 hr
9.用酚(pH8.0):氯仿:异戊醇(25:24:1)和氯仿:异戊醇(24:1)各抽提1次(10,000 rpm,4℃离心5 min)
10.取上清,1/10V 3M NaAc,2.5V体积的无水乙醇, -70℃沉淀30 min以上
11.沉淀用75%乙醇漂洗,风干, 溶于200 ulTE中,-20 ℃保存备用
DNA提取液:0.2M Tris-HCl(pH 7.5),0.5M NaCl,0.01M EDTA,1%SDS,
1.真菌菌丝0.5-1 g, 在液氮中迅速研磨成粉
2.加入3 mL 65℃预热的DNA提取缓冲液,快速振荡混匀65℃水浴30 min, 期间混匀2-3次
3.加入1 mL 5M KAc,冰浴20 min
4.等体积的氯仿:异戊醇(24:1)抽提1次(10,000 rpm,4℃离心5 min)
5.取上清,加入2/3倍体积的-20℃预冷异丙醇, 混匀, 静置约30 min
6.用毛细玻棒挑出絮状沉淀, 用75%乙醇反复漂洗数次, 再用无水乙醇漂洗1次, 吹干,重悬于500 L TE中
7.加入1 ul RNaseA (10 mg/mL),37℃处理1 hr
8.用酚(pH8.0):氯仿:异戊醇(25:24:1)和氯仿:异戊醇(24:1)各抽提1次(10,000 rpm,4℃离心5 min)
9.取上清,1/10V 3M NaAc,2.5V体积的无水乙醇, -70℃沉淀30 min以上
10.沉淀用75%乙醇漂洗,风干, 溶于200 ul TE中,-20 ℃保存备用。
以上是我们常用的方法.
据说还有特别简便的一种PCR模板的制作方法,有知道的小虫能说出来分享.
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标题: 不要总是说PVP30~40会心没意义没意义的
作者: 骑士之毁灭狼牙& & 时间:
标题: 不要总是说PVP30~40会心没意义没意义的本来也没去注意,今天早上黑龙威望的时候点了个和尚轰了好一阵
基本上3四象里会有一次会心,虽然伤害不高,会心后才6000多的四象,没锁足
我会心是36.5%,准备提升到40%左右
说实在点,附满御劲的人并不算太多
我看着连出会心以为和尚穿的大都是副本套,点开他看了下
230威望武器+4件255+2件230,首饰4件+暗器全是230威望
也没去问对方多少御劲,不过按装备算的话,25%~~28%左右是肯定有的
老是看别人说会心在40左右没意义,出不了什么会心,但是实际打人的时候并非如此啊
晚点再找几个***255的试一下出会心的情况
作为CY,会心肯定要有的,但是有个底线也好一点
无聊特此水一水,好饿
作者: HeatherLuck& & 时间:
晚饭吃的好饱……
作者: 柳月狐& & 时间:
至少我的会心套能保证在控制下爆发招招会心。。。
作者: 骑士之毁灭狼牙& & 时间:
晚饭吃的好饱……
HeatherLuck 发表于
吃的什么菜,说说让我口水一下
作者: 骑士之毁灭狼牙& & 时间:
至少我的会心套能保证在控制下爆发招招会心。。。
柳月狐 发表于
招招会心,全会心套也不敢保证吧
我说这个没别的意思,只是想说一下不是全会心套并没有那么悲剧而已~
其实会心破防无非是个人喜欢而已
选装备的时候没必要那么小心谨慎嘛
作者: 柳月狐& & 时间:
破防装只能让输出变得平稳没有爆发力,副本破防确实重要,但是PK真的不必要,气纯这条路线直接全会心会伤内功就行了,原来我还打算保持300+破防的,打木桩数值确实高,但是打人稀烂啊。
作者: 骑士之毁灭狼牙& & 时间:
本帖最后由 骑士之毁灭狼牙 于
19:00 编辑
破防装只能让输出变得平稳没有爆发力,副本破防确实重要,但是PK真的不必要,气纯这条路线直接全会心会伤内功就行了,原来我还打算保持300+破防的,打木桩数值确实高,但是打人稀烂啊。 ...
柳月狐 发表于
但是会心套没控住人输出也并不高啊
其实破防没必要特意去保持啊,有个好的五彩的话,178+经脉50,就已经200多破了~
而且破防如果没有对方内防高的话,会出现减伤的
这个刚到80不久我就试过了,减伤几率还挺高的
现在如果经脉点了内防加装备什么的,算上秀气和般若,一般内防都能在350左右
至少得保证破防高于对方内防才OK啊
作者: HeatherLuck& & 时间:
本帖最后由 HeatherLuck 于
19:05 编辑
骑士之毁灭狼牙 发表于
莲藕 甘蓝 白粥
作者: 骑士之毁灭狼牙& & 时间:
莲藕 甘蓝 白粥
HeatherLuck 发表于
。。。。。说实话好久没喝粥了。。。现在想想真的挺流口水的。。。
作者: HeatherLuck& & 时间:
。。。。。说实话好久没喝粥了。。。现在想想真的挺流口水的。。。
骑士之毁灭狼牙 发表于
锅里还有一碗半,空投要么
作者: 柳月狐& & 时间:
但是会心套没控住人输出也并不高啊
其实破防没必要特意去保持啊,有个好的五彩的话,178+经脉50,就已经200多破了~
而且破防如果没有对方内防高的话,会出现减伤的
这个刚到80不久我就试过了,减伤几率还挺高的 ...
骑士之毁灭狼牙 发表于
没控住人神一样的气纯也打不出伤害啊。你真的确定现在还有减伤机率么?反正我是没碰到过。。。
作者: 骑士之毁灭狼牙& & 时间:
没控住人神一样的气纯也打不出伤害啊。你真的确定现在还有减伤机率么?反正我是没碰到过。。。
柳月狐 发表于
恩,这个我在开了230之后也双开号测试过的,确实会出现减伤的情况,我之前发过贴不过忘了什么名字了~
晚点不卡我再试试
作者: Mascara须须& & 时间:
我不是很早就40会心了么。。
你们不信我的~~没办法
作者: 孤寂浪天涯& & 时间:
但是会心套没控住人输出也并不高啊
其实破防没必要特意去保持啊,有个好的五彩的话,178+经脉50,就已经200多破了~
而且破防如果没有对方内防高的话,会出现减伤的
这个刚到80不久我就试过了,减伤几率还挺高的 ...
骑士之毁灭狼牙 发表于
这个确实作为会心套的前提条件之一
一般破防300就可以
五彩178+经脉50+破防武器=300
作者: 任子轩& & 时间:
我想问一下,1:***威望装命中太低,命中附魔到哪个部位好呢?2:还有就是七星和捉影的取舍,总觉得七星很鸡肋。3:是韬光和临风的取舍。纠结啊。找不到人解答
作者: 骑士之毁灭狼牙& & 时间:
命中看你缺多少吧
头部好象是53吧
衣服裤子是70
好象31.7就是1%吧
作者: 孤寂浪天涯& & 时间:
腰带45或42
帽子55或53
作者: 任子轩& & 时间:
天拉,我命中94%多,不可能***都付命中吧?
作者: 孤寂浪天涯& & 时间:
护手,帽子,下装附魔就够100了
作者: 任子轩& & 时间:
那镇派呢,捉影和七星的取舍,韬光回豆和生阳的取舍
作者: 流星蝴蝶?剑& & 时间:
头手裤子,正好命中100.05%,一点都没浪费.
作者: 流星蝴蝶?剑& & 时间:
喜欢打群架的用会心装秒人,点临风捉影八荒,锅现在把混元伤害都改成血红色了,杀人刺激,喜欢单挑的用破防磨人,可以点临风也可以点生阳,七星必点。
作者: 流星蝴蝶?剑& & 时间:
楼主没必要跟纯会心装的气纯争论,锅也是纯会心会伤,包括石头,群P混战取人头爽到一逼,但是单挑就比较逊色了,少了七星的套路,血抗也低,往往不能撑到爆发的时机出现,不过这并不影响会心装在野战中的疯狂杀戮。
作者: 叶落雨& & 时间:
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作者: 水蓝色的旋律& & 时间:
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作者: 凌羽落& & 时间:
事实就是这样
作者: 三星某某& & 时间:
会心有个三十几,就去堆堆破防攻击
作者: 闲云飞1& & 时间:
那是你看着的4象会心6000 ,,有郊伤害有可能是2000
作者: 南宫白衣& & 时间:
剑纯,命中100.17会心50会伤234破防400攻击6600
作者: 我思我念& & 时间:
难道上我上图吗?我就40多会心了!
作者: ? 笑。& & 时间:
破防377,LZ打HS不定身有6000表示很怀疑.我打HS会心就5000+左右.
作者: 长恨殇& & 时间:
这个不好说得。。纯会心~
作者: 皎弟& & 时间:
求指教,13阶纯会心套,项链、腰坠是破防,会心44多点,手和腰带FM命中,头、衣、裤FM破防,攻击才9300多点,破防接近300,命中97,打架叫个悲剧,现在应该怎么选择,比如FM 还有攻击低的太离谱了吧???
作者: Aze& & 时间:
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作者: 骑士之毁灭狼牙& & 时间:
本帖最后由 骑士之毁灭狼牙 于
13:52 编辑
/hu/attachment//f.jpg破防377,LZ打HS不定身有6000表示很怀疑.我打HS会心就5000+左右.
? 笑。 发表于
怀疑吧,没事,我是懒得去弄图了,爱信不信哈
另外说一下,我破防400出头,攻击比你高1300
我本来只是想说40左右会心对于大部分威望套的人已经足够,没必要太夸张,怎么被你一说我成了来炫伤害似的
作者: 水蓝色的旋律& & 时间:
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作者: fergwgwege& & 时间:
人品一出天下无敌,话说当初点奇穴有人连通7个的又能说明什么呢。
作者: JS你还能做游戏么& & 时间:
看好对方没解控时候&& 大道定6秒 果断开 回豆 开外丘 甩无我甩天地 接 剑冲 接 人剑 甩无我 接悬钟 甩天地甩无我 甩无我 轰死他们
作者: 孤寂浪天涯& & 时间:
全身装备齐了
极品五彩石打了
每天呆在黑龙
欢迎光临 剑侠情缘网络版叁 (http://jx3./)
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