故事讲述了隋唐之间，南朝陈的末裔陈靖仇，为报答师傅的养育之恩，而继承了父辈们的遗命，踏上复国之路的故事。不过游戏主题却是讲述爱情，并且刻画动人，因而广受赞誉。本作在系统上新增符鬼系统，玩家可以用收化的妖魔喂养符鬼，使其成为战斗中的得力助手。这也是轩辕剑系列采用二维游戏界面的最后一个作品。
“人间有情，更胜天道”《轩辕剑3外传：天之痕》在《轩辕剑》系列中无疑是一款拥有众多玩家，人气很高的经典之作。它的故事背景庞大复杂，人物情节刻画生动感人，在当时打动了无数玩家的心，可以说做到了一个RPG游戏理应做到却也是最难做到的高度。从画面上来说，中国古典水墨画的风格和现代游戏3D技术在《天之痕》中被完美地结合起来，较前作有了明显的进步。背景音乐始终围绕着游戏的情节，浓郁的古典风情更是对情节有着推波助澜的作用。而战斗系统则沿用了前作一贯风格，并在此基础上有所改进。70个场景的转换也足见制作班底的功力。总体而言，作为一款国产RPG游戏而言，它无疑是经典的，拥有如此之多的fans也不可以说是没有道理的。
隋朝（北朝）灭了南朝（陈朝）之后，隋文帝杨坚大肆屠杀陈氏遗族，忠臣陈辅冒死将尚在襁褓中的主角救出，并以「靖北虏，复国仇」为他命名，将所有的复国重任，全都寄托于他身上。但长大后的陈靖仇却个性温柔，只喜欢诗词与音乐，非常讨厌杀戮，一心只想过着与世无争的平静生活。但为了报答师父的救命和养育大恩，他还是硬著头皮、半敷衍地学习着武功和道术。
《轩辕剑三外传天之痕》和《上古神器2、 3》女主角一号，昵称小雪，自幼孤儿，由月河村客栈老板贺老伯扶养，有一弟弟。出身于北方贫穷破落小村中，满头白发被当地村人认为是不祥的象征，备受歧视。后来她的村子被村人祭祀的“河神”所摧毁，村人把责任全部归咎于她，她因而被永远逐出了自己的故乡。在无依无靠之下，男主角陈靖仇邀她与自己一起旅行。后在仙山岛仙人的帮助下得知自身乃十大上古神器之一的女娲石转世，并与阿仇成功修补了天之痕。游戏最后的两个结局，玉儿结局中小雪会为救活玉儿而变为原形——女娲石，而在小雪结局中则会与阿仇一起生活。
北方胡人出身，善使长刀，冷静聪敏，行事磊落，十分信任自己的能力，有时流于太过于自我，常忽略旁人感受。拓跋玉儿本是拓跋部落（鲜卑）遗民，世世代代保护拓跋族之神器「神农鼎」。年幼的她有一次随族人外出游牧时，留守的部落遭隋炀帝为了凸显天威而发兵侵略袭击，父母惨死，神鼎也因而被夺。拓跋玉儿自此对隋人产生极深之敌意，苦苦恳求她的姐夫张烈教她武艺，日日勤练，打算伺机偷偷南下找回神鼎，并替父母复仇。
在与陈靖仇的历险中，与陈渐生情愫，在某条支线的结局中，与陈结合，幸福终生。还有一结局就是玉儿被独孤宁柯杀害，后在一个可以还魂的阵法中并没有复活，为见阿仇，连续7世只有20年阳寿。
《轩辕剑参外传：天之痕》是一款从PC平台上移植过来的游戏，在PC平台可以说是无人不知。故事，发生在「轩辕剑参」之前一百五十年前的中国，时代是中国的隋朝。 陈国遗民悲痛祖国亡灭，在公元六○一年，集结了数万兵马，兴兵反抗，意图复兴故国。隋文帝立即下令平乱，然而让陈国反抗军讶异的是：朝廷的平乱部队竟然只 有二十人不到之兵马，而为首之人，竟是一位年仅十岁之少年！这位身披斗篷的神秘少年，以一把神秘的「黄金之剑」，在仅仅一击之间便将数万陈国反抗军马一瞬 消灭殆尽、灰飞烟灭。神秘少年与天下无敌之黄金剑「轩辕剑」威名，自此令所有人闻之色变，再也没人敢起兵反叛朝廷。
首先***游戏主程序(APK)，然后解压数据包，里面有一个"com.softstar.swd3e"文件夹，将其复制进入"SD卡Android/obb/"目录下，如果没有相应目录请自行新建，注意大小写区分
1、月河村跟客栈左边的乞丐对话，他会请你帮他打水，在左下方的井中连打了15碗拿回去给乞丐可以得到金创药X1，打完井里的水可以得到银两X150与剩余的清水X9。
2、雷夏泽跟公山夫人对话后可以，赢了可得不老之泉水X1。
3、黑山镇跟药铺的李瞳儿对话得知她要搜集九样花木（龙舌兰、博落迥之根、海檬果、山蛇莓、龙骨木、紫藤叶、延胡索之花、大叶合欢散、菟丝魔子），帮其搜集部分可得嘉果X1，搜集全部可得天山雪莲X1。【这个要很久之后才能收集齐】
4、黑山镇跟民房里的馨馨对话可以跟她玩五、十、十五，赢了可得翠玉金钗X1。
5、芦家渡跟客栈右边一直喊伤脑筋的老张对话3次，选“不帮”将无法再与其对话，选“资助一百两”可得紫玉冰晶X1，选“资助三百两”可得映霞钢环X1。
6、芦家渡跟右边民房里的杜大娘对话得知芦家渡藏有宝藏，依次调查码头、阶梯左边的大石、杂货商杨老板的伞、码头附近的五个罐子可得地稔根X1。
7、大梁跟街上的三个小孩对话可以猜谜，选“小四”可得神秘果X1。第二次到大梁可猜另一题，选吕公可得玉山佛甲草X1。【要去大梁药铺买白色药材至少3份，后期支线会用到】