新修版最引起新版读者非议之处，就是改动部分人物的性格，扭转了读者的既定印象，一些以书中人物为偶像的读者，更为此而感到愤愤不平。有趣的是，新修版对人物性格的改写，几乎全是「由专情改为多情」，金庸甚至解释道：「天下的男人都是不专情的，信不信由你了。」
旧版及新版《射鵰英雄传》中，黄药师对妻子冯氏的专情，着实令人印象深刻。在新修版中，金庸大笔一改，黄药师爱上了女弟子梅超风，平时会写些「恁时相见早留心，何况到如今」之类的词句，也常感叹自己韶华易老。日后梅超风情定陈玄风，令黄药师情绪失控，震断曲灵风的双腿。接着为了杜绝「师生恋」的传言，黄药师离开桃花岛，娶回与梅超风同龄的冯氏，想来冯氏是黄药师情感转移的「替代者」。这段改写在当年发布新闻稿之后，引起诸多金迷的口诛笔伐，正是由于黄药师的专情形象完全逆转之故。
2 、旧版及新版《碧血剑》中，袁承志均钟情于青青一人，新修版则改为袁承志亦狂恋阿九。新版中，袁承志潜入皇宫，因情况危急而躲入阿九被中，与她合衾共枕，袁承志将金蛇剑置于两人之间，并声明自己绝非轻薄无礼之人。在新修版中，袁承志拿开金蛇剑，二人紧紧拥抱，激情热吻，袁承志心中几乎已生「邪念」。
、旧版及新版《天龙八部》中，段誉是单恋王语嫣的痴人，最后精诚所至，金石为开，王语嫣离开慕容复，段誉终能抱得美人归。在新修版中，段誉追求到王语嫣之后，开始「清算旧帐」，计较起从听香水榭到少林寺外，王语嫣一件又一件对不起自己的事，还为自己找到合理的解释──原来他之所以苦恋王语嫣，全因「心魔作祟」的缘故。其后段誉迎娶木婉清、锺灵及银川公主的侍女晓蕾等姑娘为妻。
4 、旧版及新版《天龙八部》中，李秋水直至年老，都仍为无崖子的爱情与天山童姥争斗。在新修版中，李秋水一度「由爱生恨」，与丁春秋产生私情，此事为天山童姥告密揭发。事发之后，李丁二人合力将无崖子打落悬崖。
5 、新修版《神鵰侠侣》中的小龙女，在情感表达上更大胆了些。在大胜关英雄大会中，新版写小龙女久别后见到杨过，只说了句：「过儿，你果然在此，我终于找到你了。」新修版则让小龙女告诉杨过，一天要想她五百次，还要杨过喊她「媳妇儿」，不准变心。小龙女摆脱了冰山美人的形象，勇于说出感情，表达爱的能力丰沛了许多。
6、 旧版及新版《神鵰侠侣》中，金轮法王虽然喜欢郭襄，毕竟仍不脱为求名利、不择手段的形象。在新修版中，金轮法王改称金轮国师，襄阳大战时为救郭襄一命，金轮国师竟舍身相代，尽全身之力挥走火柱，力竭而亡。改写后的金轮国师，心地慈悲得多了。
7、 新版《天龙八部》中，徐长老是个秉公为国的丐帮长老，但是在新修版中，却将他改成了老色头。马夫人登门求助，徐长老藉机揩油，更对马夫人伸出禄山之爪，正义形象荡然无存。
六、将人物的含蓄情感表达得更为深刻： 细心的读者当不难发现，新版中性格较木讷、情感较含蓄的人物，如《射鵰英雄传》中的郭靖、《侠客行》中的石破天等人，在新修版中，他们谈情说爱的词句都加了些料，使其可以更自然地吐露内在的感情。这正是新修改版的重点之一。
8 、《天龙八部》中的萧峰，在新版中是个极为豪迈的角色。萧峰击伤阿朱后，新版描述萧峰「泪水直洒了下来」，新修版则改得更为柔情：「他（萧峰）低头去亲吻阿朱的嘴唇……两人的泪水混在一起，都流到了唇边。」这么一改，让铁汉的温柔更显凄迷。9 、《神鵰侠侣》中的杨过，本就是较能表达情感之人，新修版让他发挥得更加淋漓尽致。杨过、小龙女习练《玉女心经》中的一招「亭亭如盖」时，杨过罩在小龙女身上，二人情欲陡生。此外，杨过表露爱意更显露骨，他告诉小龙女，思念小龙女时会想到心不在焉，甚至将面条吃进鼻孔去。10 、新修版《碧血剑》中，苗女何惕守的言语更加无所忌惮。她见袁承志心系阿九，居然鼓励袁承志三妻四妾，一娶青青，二娶阿九，三娶焦宛儿，还告诉师父袁承志，倘使世上无阿九这人，她自己也挺想嫁给他的。11 、新版《鹿鼎记》中，康熙鲜少过问韦小宝的多妻婚姻，在新修版中，康熙则要求韦小宝以建宁公主为正妻，不得让她做小妾。这一改写，增添了康熙的温情。康熙与建宁虽非亲兄妹，他仍能念及自幼御兄妹相伴之情。
七、将书中情节周延化，使故事更加圆融：
12、 新版《射鵰英雄传》中，陈玄风盗走《九阴真经》下卷，将真经经文刺于胸口，再将原经烧毁。这段故事虽然颇为奇妙，但是读者怀疑，数千字的经文如何刺于胸口肌肤？在新修版中，金庸将人皮抄本一节删改，陈玄风、梅超风手拥纸抄本，最后梅超风将抄本归还给师父黄药师，受允重入师门。
、新版《射鵰英雄传》中，江南五怪于桃花岛遇害一节，描述得不甚周延，如朱聪写下：「事情不妙，大家防备（西字起首笔划）。」以及南希仁所书：「杀……我……者……乃……十……」读者不免质疑，身处危急之中，那有时间这般留下线索？这一大段情节，在新修版中完全改写，删除朱聪纸上示警之举，改为韩小莹于墓室玉棺上留下「十」字，南希仁则留下「西」字起首笔划。另补充杨康自欧阳克处取得桃花岛总图，因而知晓墓门开启之法，使整个布局更为缜密。
14、 新版《倚天屠龙记》中，倚天剑、屠龙刀中所藏《武穆遗书》与《九阴真经》，写于极薄的绢片之上，但是读者不解，何以绢质秘籍耐得住高温而不烧毁？于是金庸做了大幅改写，将两部秘籍藏于桃花岛，而倚天剑、屠龙刀中所藏的却是两块玄铁片，玄铁片上刻有秘籍所在地图及入岛方法。为了取得兵法及武学秘奥，周芷若将峨嵋总门迁往定海，终于顺利取得两部秘籍。
15、 新版《倚天屠龙记》中，谢逊被监禁于少林寺后山时，在地洞壁上刻下周芷若的罪行，这对目盲的谢逊来说，未免过度为难。在新修版中，此揭秘任务交给了黄衫女子，她并将内有周芷若相关罪行证据的小包交给张无忌。张无忌拆开后，见到了十香软筋散，以及倚天剑、屠龙刀中的玄铁片，终于明白自己误会了赵敏。
、新版《倚天屠龙记》中，武当六侠欲以「真武七截阵」迎战少林诸僧，需要殷素素入阵以全七侠之位，殷素素求教于俞岱巖，让俞岱巖认出了声音，殷素素不得不承认自己托龙门镖局护送俞岱巖之事，导致张翠山自刎身亡。新修版做了大幅改写，武当六侠不再拘泥于「真武七截阵」，而殷素素则因少林和尚圆业咄咄逼人，责问张翠山有关龙门镖局灭门之事，愤而挺身护夫，自承托镖护送俞岱巖，并杀害龙门镖局满门。接着她进入内室，向俞岱巖坦承偷施蚊须针，张翠山闻之愤而自刎。这段改写，让殷素素从不敢面对现实的邪女，转为敢于面对错误、为夫承担的勇敢女子。
17 、新版《倚天屠龙记》中，朱元璋使鬼蜮伎俩逼退张无忌，让张无忌误以为徐达、常遇春二人对自己不满，在失望之余离开明教。由于这段阴谋太过戏剧化，在新修版中，改为朱元璋光明正大地率兵逼宫，要张无忌在明教与赵敏之间二择一。爱美人胜于江山的张无忌，最后自然选择赵敏，离开明教。
18 、新版《倚天屠龙记》中，面对叛派弒叔的宋青书，张三丰掌击其胸而毙其命。新修版改为宋青书想向太师父及父亲拜倒，用力过度，伤口迸裂而亡，修改了张三丰手刃徒孙的不圆满画面。
19 、为什么玄慈等一干武林人物，对于误击萧远山一家，事后罪恶感如此之大？新版《天龙八部》并未交代清楚，新修版补足了缘由。原来萧远山于辽国担任属珊大帐的亲军总教头，平日颇得辽国帝后赏识，常藉机劝阻辽帝对宋用兵，是维持宋辽和平的重要人物。萧远山有大恩于武备较为落后的大宋，玄慈等人误击其全家，遂觉满身罪愆。
20 、小说改版时，少见金庸创造新人物，但是在新修版《天龙八部》中，却创造了传功长老吕章。吕章在萧峰离去、徐长老和白世镜身败名裂之后，成为丐帮实际上的领导人，然而他给丐帮的指示和方向，却是隐瞒帮中长老的恶行，全力抹黑萧峰。吕章的领导方式，让萧峰更加认清江湖上重利轻义的现实面，因而加深他北上赴辽的决心。
21、 慕容博诈死后，人到那里去了？新版《天龙八部》中，只知他到少林寺盗取秘籍。在新修版中，慕容博「死后」仍为复国大业而努力，化名为燕龙渊，于两淮一带出没，发出慕容氏的黑色令旗，广纳江湖豪杰，以为复国之助力。
22、 不仅慕容博于暗中收帮纳派，四大家臣亦有相同的努力。新版《天龙八部》中，秦家寨与青城派众人上听香水榭生事，由于技不如人，给包不同羞辱一顿后赶了出去。在新修版中，包不同收敛起暴躁脾气，着意结纳，秦家寨与青城派均接下姑苏慕容氏的「黑色燕字旗」，从此接受慕容家的号令。
23、 以玄慈方丈的身分与武林地位，当江湖上传闻纷纭，说乔峰将武林挑得腥风血雨之时，他这「带头大哥」为何从未出面？新版《天龙八部》中无解。在新修版中，玄慈等五位少林高僧化身为迟姓、杜姓等老者，于乔峰前往五台山会见智光大师的路上，对乔峰做过一番人品鉴评。在乔峰宁可自伤而不愿伤害迟姓老者的当下，明白了他仁义本怀的光风霁月人格。
24 、旧版、新版《天龙八部》中，萧峰被冤枉杀害副帮主马大元，在追查带头大哥的过程中，亦几乎处于挨打的地位。新修版中，金庸帮萧峰稍吐一口胸中怨气，在马夫人家中假扮马大元鬼魂之人，由萧远山改为萧峰，让萧峰以己之力，洗清被误会的冤屈。
前文曾经提及，在旧版改新版时，神山上人问难于少林寺，新版主要针对波罗星于少林寺盗窃秘籍之事。到了新修版《天龙八部》，则将哲罗星、波罗星等「冗情节」全数删除，神山上人身为徐长老的师弟，以徐长老之死，藉机向少林寺挑衅，使全书各个环节更为连贯。八、将武学的源流与内容阐述得更加明白： 在金庸小说里，金庸以自己的臆想发明了一些武功，而这些武功的源流有时交代得不够周延，于是在新修版中，金庸便尽量将之修补得更完美。
25、 新版《神鵰侠侣》中，觉远提到《九阳真经》乃达摩祖师亲手书写，但金庸或许经过考量：「九阳」一词为道家所用的易术之词，因此在新修版中，将《九阳真经》改为由另一位不知名的高手书写在《楞伽经》的行间中。
26 、金庸花费许多精神打造「降龙十八掌」，除了前段提及的源流，在新修版《射鵰英雄传》中，金庸还增添两页篇幅，详细说明这套武功的要义，并提及「亢龙有悔」乃「降龙十八掌」的根本，招式中最难之处在于强力击出时，仍能留有余力，当刚则刚，应柔则柔，打破「降龙十八掌」一味刚猛的旧观点。
、鸠摩智为何身负「小无相功」？对新版《天龙八部》的读者来说，这始终是个谜团，而这谜团在新修版中有了解答。段誉在朱碧双姝相助下于「锦瑟居」逃脱，其后鸠摩智因缘际会潜入王夫人家的书库，暗中盗取丁春秋藏于王家的「小无相功」秘籍。这段增写，不仅交代鸠摩智习得「小无相功」的过程，甚至写出神功内容供读者品阅：「古之善为道者，微妙玄通，深不可识……孰能浊水静之徐清，孰能安以动之徐生……」由于鸠摩智偷书时漏取第七册，导致强练内功而积下戾气，无法化解。
28 、新修版《神鵰侠侣》中，将金轮国师的武功源流说明得更清楚。金轮国师出身金刚宗，随身携带莲华生大士唐卡，而他传授郭襄的武功，最基础的就是金刚萨埵的瑜伽密乘。
新修版《神鵰侠侣》既增写古墓派「玉女心经」的招式内容，亦适当地让杨过、小龙女在武术实战中有所发挥。绝情谷中的杨龙与公孙止之战，新版中为杨龙二人落败，但是在新修版中，一来删去公孙绿萼使渔网阵时假意摔倒的情节，变成杨过使「天罗地网势」脱离渔网阵；二来杨过以「玉女拳功」攻击公孙止；三来小龙女与杨过相认的情节有所改写，小龙女忆起从前为练功而击打小杨过屁股的往事；四来加写杨过以「玉蜂针」打中公孙止的穴道，公孙绿萼为父亲讨玉蜂浆解痒。最后，杨龙使出「玉女心经」中的「亭亭如盖」，击败公孙止，却在宽恕公孙止后意外遭其偷袭。
30 、除了武术之外，新修版《笑傲江湖》中亦增写〈笑傲江湖曲〉的内容。原来曲洋自蔡邕墓中所盗得的〈广陵散〉琴谱，述说着「聂政刺韩王」的故事，刘正风再加上一段箫谱，奏的是聂政之姊收葬弟尸之事，曲刘二人合奏而成〈笑傲江湖之曲〉。
九、束缚江湖人物，勿使改变历史： 或许在心理上，金庸一直不希望武林人物拥有扭转历史的力量，甚至连扭转的空间都必须遏止。在新修版中，金庸对于「江湖」与「政治」的界线订得更为严格。
31 、新修版《倚天屠龙记》中，增补一段「阳教主遗训」，也就是明教圣火令上所刻的「三大令、五小令」，而「圣火令三大令」的第一令即为「不得为官为君」。这一改写，将张无忌的开国皇帝希望完全堵死，绝对不致产生影响历史的效力。
32、 新修版《碧血剑》中，新增一段十六字诀来绑住袁承志，便是：「不降鞑子，不投朝廷，不跟闯王，不害良民。」如此一来，中土既已无容身之处，袁承志只得远渡海外，再也无法影响中原政局。
十、删除「非必要」的情节：
新修版不仅有增修，「胖女人」亦确实做了「局部减肥」。也许金庸认为部分新版情节是多余的，因此将之删去。
33、 旧版与新版《碧血剑》中，均有何铁手对女扮男装的青青心生情意，甚且开口示爱的情节。或许金庸觉得这事无关整篇小说，又或许觉得女子爱上女扮男装者太过陈腔滥调，于是删改了此段情节。
34、 新版《碧血剑》中，袁承志追查五毒教，先见到黑白蓝黄红五道围墙的无门大宅，其后又见「锦衣毒丐」齐云璈于雪中斗蛇。或因这段情节太过玄异，金庸大笔一改，变成惠王爷以「招贤馆」名义引见，袁承志因而得见五毒教诸人。
35 、新版中部分情节属于既无关全局、又篇幅较长的武术对战描写，金庸于新修版中将之删减：
a. 新版《射鵰英雄传》中，郭靖曾与黄河四鬼对打，这段纯武 术过招的描述可能过于冗长，在新修版中被大幅删节。b. 新版《天龙八部》中，木婉清与王夫人手下追捕者的对打，亦有大幅删裁。c. 新版《天龙八部》中，摘星子与阿紫以绿火相斗的过程，包括摘星子的思绪转折，以及星宿派门人的谄媚谀词，在新修版中多所删削。d. 新版《天龙八部》中，慕容复与黎夫人、桑土公的交战，在新修版中已全面删除。e. 新版《碧血剑》中，崔秋山与围堵圣峰嶂的官兵们恶斗的段落，亦被删削。f. 新版《神鵰侠侣》中，丐帮追索陆无双而被杨过击退的情节，一在客店，一在花轿，两段都被删掉了。g. 新修版《神鵰侠侣》中，删去忽必烈的谋士和尚子聪斟毒酒给周伯通，周伯通反愈喝愈多，甚至喷出毒酒一节。
36、 倘若无关故事主轴的进展，被金庸以「冗情节」视之，删削亦属自然。如新版《天龙八部》中，薛慕华回溯游坦之携慧净和尚前来求诊的段落，在新修版中大幅删修。此外，「函谷八友」的个人表现也做了局部削减。十一、注释增多：
37、 新修版有个特色，就是「注释」明显比新版来得多。旧版时的注释，往往只以括号写一两句金庸注，新版多了些解说史事的注解，而新修版则不仅回末注释变多，其中更有金庸为自己提供平台，让作者向读者说说话。
a.针对叶洪生曾经提出「三花聚顶、五气朝元」乃内功入门功夫，梅超风必知的说法，金庸特别在新修版《射鵰英雄传》第十回末的注释中提出说明。文中引用《锺吕传道记》吕洞宾求问锺离权「三花聚顶、五气朝元」一事，大法精微奥妙，且易与求仙之术混同，证明梅超风有此一问，并不奇怪。
b.关于小龙女、杨过的师生恋引发某些读者质疑，金庸在新修版《神鵰侠侣》第十四回末的注释中，洋洋洒洒写下一大篇幅，告诉读者古今中外某些婚姻制度的不合理，又举钱穆、梁实秋等今人师生恋遭社会非议之事，供读者做小说与现实的参差对照，读来实在颇为有趣。
、金庸不仅于注释中向读者说明清楚，偶尔还会神来一笔，在小说中穿插一段情节，借着虚构人物之口，为自己提出辩驳。 早在旧版时代，化名佟硕之的梁羽生曾经写过一篇〈金庸、梁羽生合论〉，文中质疑金庸在《射鵰英雄传》中让黄蓉唱〈山坡羊〉，是「宋代才女唱元曲」，在历史背景上乱了套儿。在新修版《射鵰》中，金庸则借云南杨老者之口告诉读者，他的先人自唐朝天宝年间移居南诏，〈山坡羊〉的曲子由祖先所传下。可知〈山坡羊〉在唐代即已广传民间，宋代的黄蓉吟唱此曲，并不悖理。