楼主你好，总共有这些。
第3集：对战劲敌 三对三 
第52集：双人合作赛！决胜战！（小智和真嗣合作）
第100集：嫩苗龟、树林龟…然后土台龟！
第118集：神奇圆环！天空大决战!
第131集：全员对战！真嗣对抗小智!! -前篇
第132集：全员对战！真嗣对抗小智!! -后篇 
第187集：激斗全员对战！小智对抗真司！
第188集：最终劲敌对战！小智对抗真司！
就是这些，楼主满意的话请采纳~~

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除了一直使用的皮卡丘外，还有那个第二部收复的长尾猴，跟小光换叉尾浮鼬那个小精灵，就是AG版收复后跟小智来的，其他的话没有了，不过钻石珍珠182集小智以前在大木博士那的神奇宝贝集合了，准备一起挑战新奥联盟啦

神奇宝贝钻石与珍珠剧情介绍：第101集 缘之道馆赛！VS梅丽莎！！

　　小智终於要迎接与缘之道馆的道馆训练家梅丽莎的道馆赛！梅丽莎派出的第一只是「影子神奇宝贝」的耿鬼，小智则选择了泳气鼬。虽然泳气鼬自负在对战时有绝对的自信，却因为耿鬼那幽灵系特有的动作而陷入严峻苦战！更雪上加霜的是，梅丽莎的神奇宝贝使出最擅长的绝招「催眠术」！为了防堵这个战术而再三特训的小智与神奇宝贝们，终於面临测试秘密计策的时刻，但是…。究竟最後，小智能不能从梅丽莎手中取得胜利，拿到第五个徽章呢？

神奇宝贝钻石与珍珠剧情介绍：第102集 混战混乱的水脉市！

　　经过飞行船航程，小智一行人抵达水脉市。可是，埋伏在那的火箭队的圈套，让小智一行人和手边的神奇宝贝都走散了。想著「先找到就能收服！」的武藏、小次郎为这大好良机而狂冲！小智等人也急忙追赶上去！另一方面，在小智等人正在搜寻的皮卡丘面前出现的，是火箭队的喵喵。虽然理所当然的警戒，但喵喵的样子和平常不同：？它竟然说要退出火箭队，成为小智一行人的同伴！於是，皮卡丘它们和喵喵一起行动。究竟喵喵的真实心意为何？皮卡丘它们能够平安回到小智一行人身边吗？

神奇宝贝钻石与珍珠剧情介绍：第103集 克雷色利亚对达克莱伊！

　　水脉市由众多岛屿组成，小智一行人造访了其中设有水脉道馆的岛屿。虽然提出道馆赛的要求，但现身的人却是有严重黑眼圈的道馆弟子。告诉小智一行人道馆训练家不在的弟子，甚至在打了个大呵欠之後就直接站著睡著了！正当大家感到不可思议开始观察的时候，对方却突然发出惨叫惊醒、然後跑走了。不明所以的小智一行人，到镇上的警局去问询问君莎***才知道，这座岛上的人似乎都因为每晚做恶梦导致睡眠不足。而且，询问缘由後更听到了惊人的***！原因竟然是「暗黑神奇宝贝」…。

神奇宝贝钻石与珍珠剧情介绍：第104集 羊羹与洛托姆！

　　暂时停留在水脉市的小智一行人，和久违的大木博士联络时，听说了只在「森之洋馆」饭店才吃得到的「森之羊羹」的事，立刻决定要去吃羊羹。但是，不巧碰上旅馆停业，而且还听说旅馆有妖怪出没！就在大家准备放弃的时候，应该没人的旅馆大门自动打开了！小智等人大吃一惊，唯独皮卡丘发现到什