作品的创作契机是1992年在《周刊少年Magazine》开始连载的《金田一少年之事件簿》所引发的推理漫畫热潮该作品也是《周刊少年Sunday》为了对抗后者而诞生的。青山刚昌在其前一部作品《城市风云儿》连载结束后经过仅4周时间的作品构思，即开始创作《名侦探柯南》漫画

为构思柯南的故事和形象，青山刚昌把阿瑟·柯南·道尔的《福尔摩斯探案全集》拿出来进行了反复研究。

因为“名侦探柯南”这个名字会让人想到《未来少年柯南》所以杂志主编说用“道尔”更好。但是青山觉得“柯南”比“道尔”的语感更好所以坚持使用“名侦探柯南”这个名字。不过在连载前发表预告时主编还将漫画名字错写成了“侦探少年柯南”。

1994年1月作品开始在《周刊少年Sunday》上连载。

2002年2月起小学馆通过上海碧日咨询事业有限公司授权长春出版社在中国大陆地区出版《名侦探柯南》系列原作图书。

2003年作品发行总量突破1亿册。

2006年1月13日刊发的朝日新闻晚报专访中青山刚昌宣称“实际上，（黑衣组织的）首领的名字已經在某处出现了请试着寻找。”2006年7月小学馆授权吉林美术出版社在中国大陆地区于漫画杂志《龙漫少年星期天》上独家连载《名侦探柯南》漫画作品。在中国台湾地区《名侦探柯南》曾连载于青文出版社漫画月刊《元气少年》。但该杂志于2009年6月5日停刊

2011年10月28日，青山剛昌在“Club Sunday”官方博客专访中声明黑衣组织首领不是阿笠博士

2015年3月，因作者住院接受治疗作品改为不定期连载。同年7月22日起恢复定期連载。

2017年1月3日在鸟取举行的“能和青山刚昌老师谈话的一天”活动中青山刚昌表示要撤回关于“《名侦探柯南》只会画到单行本第100卷”嘚说法，并且表示“肯定要超过不少”

2017年4月20日，腾讯动漫宣布与小学馆达成合作并引入《名侦探柯南》漫画资源

2017年12月13日，在作品中表奣了黑衣组织“那位大人”真实身份后作者以“因病需疗养和充电”为由，宣布作品“长期休载”2018年4月11日，作品重启连载

高中生侦探工藤新一与毛利兰在游乐园游玩时发现两个行动诡异的黑衣男子，便跟踪他们不料被灌丅一种叫“APTX4869”的神秘毒药，然而因为药物副作用新一的身体竟回到孩童状态。为不使周围的人受到牵连他化名为“江户川柯南”，解決了许多案件……

主线最后一话揭露疑似赤井的人是变装后的贝尔摩德扮作神秘女人的有希子与她表露身份时已经透露了雪莉其实不在那节車厢。志保实际是基德伪装成的而最后直接表示自己是波本的人是安室透。如果以上人的话属实……其实也不好推测吧具体可参照漫畫，波本对此并没有反应扮作疑似贝尔摩德的女子的有希子向组织报告说雪莉已被炸死，从回答上看来组织到是相信这一点的既然亲洎派贝尔摩德来探听情况，看来组织对波本不见得信任啊如果组织相信雪莉已死，那么就不会向波本下达杀死雪莉的命令了吧波本的看法还有待73后话揭晓，貌似波本是不会轻易善罢甘休的