“虚拟机设置把每一个站点都独立化与其它站无任何关联，独立运营”，
每一站都独立吗？比如我现在用一个成熟的cms系统(比如wordPress)来开发然后用它建立站点，只用了一个wordpress核心但是配置了多个站点，分别对应多个数据库这几个站关系是怎么样的啊？

 那你自然要把cms复制若干份，然后每一份根据不同的需偠建不同的网站并配置不同的域名。这样的几个网站都是独立的功能、数据、管理均独立。
你是想用一个CMS后台就建若干个站么？我沒怎么用过CMS应该也有这样的CMS吧，不过相信wordpress不是这样如果这样的话，那就是一个后台管理若干个网站相当于某一部分下的几个不同小組。功能和数据独立管理不独立。