用perl从一个TXTperl文件读取(图一)提取DNA序列到fastaperl文件读取(图二)中。

window下读取某个perl文件读取他的格式昰:

然后将打开的内容赋值给一个变量:

下面是一个读取蛋白质序列的程序:

格式:PPT ? 页数:54页 ? 上传日期: 01:12:27 ? 浏览次数:10 ? ? 3000积分 ? ? 用稻壳阅读器打开

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我能夠下載一個FASTAperl文件读取中手動看起來像:

通過點擊「發送到」然後選擇「基因功能」,FASTA核苷酸是唯一的選擇(這是很好的因爲這就是我想要的)。

我得到一個看起來像perl文件读取:

與混爲一談全基因組序列 如何獲取第一個(手動下載的)perl文件读取中的信息?

我看着一對夫婦的其他職位:

我試着抓取並保存一個GenBankperl文件读取(因爲它似乎對我得到的.gbperl文件读取中的每個基因都有單獨的序列)但是當我使用Bio :: SeqIO去使用它時,我將只獲得1大序列

峩想要做的是從NCBI使用腳本,而不是手動下載(這是我如何得到第一個)從第一個拉出一個fastaperl文件读取。第二個perl文件读取仍然是一個fastaperl文件读取但整個基因組都在一個序列中。所以當我在一個循環中使用'SeqIO :: next_seq()'時它只會得到一個序列。 –

参考资料

 

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