不久的将来人类在与病毒性寄苼生物“gastrea”（原肠动物）的战斗中落败。人类被逼到狭小的国土活在与恐怖为邻，与绝望为伴的环境中 在那个被封闭在黑暗的世界里—— 居住在东京区域的少年莲太郎，身为应对gastrea的专家“居民特警”的一员从事危险的工作他的伙伴是略显早熟的幼女延珠。运用特殊能仂战斗的二人在某天从**接到特别命令据其内容，这是一项很可能会毁灭掉东京的绝对保密任务…… 以不久将来为舞台惊心动魄壮绝山河的战斗就此开幕！

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