在第三十个人类千年之初（30th Millennium）沖突年代（Age of Strife）结束后，曾经繁华的地球已是一片废墟伟大的人皇无法再对人类的堕落坐势旁观，于是他结束了长达四万年的隐藏走出阴影开始了重新统一人类的征程他的第一站便是地球，及神圣泰拉（HollyTerra）为了统一泰拉，皇帝使用基因技术制造了第一批强化人类战士“雷霆战士和星际战士”（Thunder Warriors）这便是星际战士的前身
随着全银河系范围的次元风暴的消失（乐欲邪神沙力士（Slaanesh）的诞生震散了次元风暴），星际间的航线可以再度实现为了能够重新夺回人类在冲突时代中失去的殖民地人皇需要比雷霆战士和星际战士更加有效率的战士，因此他创造了二十个基因原体再以他们为样本制造星际战士虽然二十个基因原体还在襁褓之中时就被混沌邪神们掳走散布到银河系各地，泹是人皇还是使用早先取得的原体基因制造出了二十个星际战士军团并带领他们开始了大远征（Great Crusade）这二十个星际战士军团中的十八个便昰后来所知的第一次建军（First Founding）战团。这已是第三十个人类千年的第八百年（Year 800.Millennium30）
在漫长大远征的旅程中，帝皇依次与他的儿子们（基因原體）相聚由于基因原体们天神般的体能与智慧，几乎每个原体都成为了他们第二家乡的领袖或者统治者于是皇帝便将使用他们的基因原种制造的星际战士军团交还由他们领导，这大大加快了大远征的进程也为随后的荷鲁斯之乱（Horus Heresy）埋下了第一颗种子
Astartes)。明面上圣典的目的是为了帮助星际战士们更有效的作战，但实际是为了防止有人再度像荷鲁斯一样大权独揽招致叛乱而将仅存的九个忠诚星际战士军團拆分为数十个以1000个星际战士组成小型战团。这次事件被称为第二次建军时间紧随荷鲁斯之乱在第三十一个千年的第14年到15年之间。从第②次建军到现在的第四十一个千年间先后又进行了大大小小将近30次不同的建军。
在黑暗的第四十一个人类千年间古老的冤骨正在苏醒，新的威胁也在逼近而忠诚的星际战士团依然在第一线为了皇帝与人类帝国而战。