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在服务器控制台archive，手动存档后，输出文件是存在哪里的啊
rt，求高手大侠帮忙啊，还有我要在一台服务器上使用多个cpu/核，在win界面选择并行的时候提交到服务器无法计算，不选择的时候可以计算，但默认只有一个核。在win上计算的时候可以选择多个，请问是需要在哪里设置吗？我搞了好久天都搞不出来啊，求帮助
试过了，我会做那一步，但是选择多个核并行计算的时候，如图所示， parallal那里打上勾交到服务器上无法计算，点击计算的时候弹出对话框，说计算失败，不打勾的时候就可以计算，但是只默认一个核在计算。不交到服务器，而在自己电脑上选择打勾多核计算是可以的，请问各位大侠是怎么回事啊，我应该在服务器上怎么设置啊
查看你的服务器端hpmpi的***情况。
配置好ssh，nfs，正确修改machine.linux文件。
我昨天将hpmpi已经***好了，在重装软件的时候检测到hpmpi已经***上，然后就提示我在machine.linux文件修改一个节点一个节点的cpu设置，但是我是在一台服务器上使用并行啊，也需要修改machine.linux文件吗？
在后面的***中有提示mpi配置ssh，我选择的yes
nfs共享好像有的说不要共享呢，由于我还不知道怎么共享，所以还没弄这一步啊
按照我目前的***状态，提交一个作业上去一会就跳出来了，看Project Log
最后警告说的是，discover已完成：Discover has finished with no outputfile
这样还是因为并行没有***上的原因吗？我感觉好像是其他原因呢，高手能帮我分析分析吗
如果仅使用单机的话，就不需要配置machine.linux和配置NFS了。
1. 并行问题，关闭gateway（在linux下面使用~/Accelrys/MaterialsStudio55/etc/Gateway/gwstop）后，尝试在你的Gateway配置里面修改：
~/Accelrys/MaterialsStudio55/etc/Gateway/root_default/dsd/conf/gw-info.sbd
~/Accelrys/MaterialsStudio55/etc/Gateway/root_default/dsd/conf/gwparams.cfg
mpicommand=/apps/mpi/hpmpi/bin/mpirun -e MPI_REMSH=/usr/bin/ssh -prot -f APPFILE
mpicommand=/apps/mpi/hpmpi/bin/mpirun -e MPI_REMSH=/usr/bin/ssh Sample Text -prot -f APPFILE
之后重新启动gateway（~/Accelrys/MaterialsStudio55/etc/Gateway/gwstart）查看是否正常。
2. 在手动将计算作业archive之后，如果操作正常，作业会保存到/home/theall/Accelrys/MaterialsStudio55/etc/Gateway/root_default/dsd/jobs-archived目录下面。
3. 对于并行的配置也可以在gateway网页中进行，同样对gateway data中mpicommand进行修改即可。
Correlation：
因为对论坛功能使用不熟悉，上贴中内容：
mpicommand=/apps/mpi/hpmpi/bin/mpirun -e MPI_REMSH=/usr/bin/ssh Sample Text -prot -f APPFILE
mpicommand=/apps/mpi/hpmpi/bin/mpirun -e MPI_REMSH=/usr/bin/ssh -TCP -prot -f APPFILE
谢谢谢谢，真的太感谢了，我再弄一弄
呵呵，真的好感谢你啊，这个问题已经纠结我一周多了，今天按照你得方式进行修改命令终于可以了，那么我再有一个问题，在服务器控制台上stop job掉得工作，能不能再接着提交上去进行计算啊，如果可以操作方式是什么啊？
我的并行是应该可以了，但是总的CPU使用率很低啊，显示为0.0%,只有并行那几个显示100%，我的服务器是一个cpu，cpu是4个核，详细见一下：
-bash-3.2$ cat /proc/cpuinfo
processor& && & : 0
vendor_id& && & : Genuinntel
cpu family& && &: 6
model& && && &&&: 23
model name& && &: Intel(R) Core(TM)2 Quad CPU& & Q9550&&@ 2.83GHz
stepping& && &&&: 10
cpu MHz& && && &:
cache size& && &: 6144 KB
physical id& &&&: 0
siblings& && &&&: 4
core id& && && &: 0
cpu cores& && & : 4
fpu& && && && & : yes
fpu_exception& &: yes
cpuid level& &&&: 13
wp& && && && &&&: yes
flags& && && &&&: fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss ht tm syscall nx lm constant_tsc pni monitor ds_cpl vmx smx est tm2 cx16 xtpr lahf_lm
bogomips& && &&&: 5669.61
clflush size& & : 64
cache_alignment : 64
address sizes& &: 36 bits physical, 48 bits virtual
power management:
processor& && & : 1
vendor_id& && & : GenuineIntel
cpu family& && &: 6
model& && && &&&: 23
model name& && &: Intel(R) Core(TM)2 Quad CPU& & Q9550&&@ 2.83GHz
stepping& && &&&: 10
cpu MHz& && && &:
cache size& && &: 6144 KB
physical id& &&&: 0
siblings& && &&&: 4
core id& && && &: 1
cpu cores& && & : 4
fpu& && && && & : yes
fpu_exception& &: yes
cpuid level& &&&: 13
wp& && && && &&&: yes
flags& && && &&&: fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss ht tm syscall nx lm constant_tsc pni monitor ds_cpl vmx smx est tm2 cx16 xtpr lahf_lm
bogomips& && &&&: 5666.01
clflush size& & : 64
cache_alignment : 64
address sizes& &: 36 bits physical, 48 bits virtual
power management:
processor& && & : 2
vendor_id& && & : GenuineIntel
cpu family& && &: 6
model& && && &&&: 23
model name& && &: Intel(R) Core(TM)2 Quad CPU& & Q9550&&@ 2.83GHz
stepping& && &&&: 10
cpu MHz& && && &:
cache size& && &: 6144 KB
physical id& &&&: 0
siblings& && &&&: 4
core id& && && &: 2
cpu cores& && & : 4
fpu& && && && & : yes
fpu_exception& &: yes
cpuid level& &&&: 13
wp& && && && &&&: yes
flags& && && &&&: fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss ht tm syscall nx lm constant_tsc pni monitor ds_cpl vmx smx est tm2 cx16 xtpr lahf_lm
bogomips& && &&&: 5665.97
clflush size& & : 64
cache_alignment : 64
address sizes& &: 36 bits physical, 48 bits virtual
power management:
processor& && & : 3
vendor_id& && & : GenuineIntel
cpu family& && &: 6
model& && && &&&: 23
model name& && &: Intel(R) Core(TM)2 Quad CPU& & Q9550&&@ 2.83GHz
stepping& && &&&: 10
cpu MHz& && && &:
cache size& && &: 6144 KB
physical id& &&&: 0
siblings& && &&&: 4
core id& && && &: 3
cpu cores& && & : 4
fpu& && && && & : yes
fpu_exception& &: yes
cpuid level& &&&: 13
wp& && && && &&&: yes
flags& && && &&&: fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss ht tm syscall nx lm constant_tsc pni monitor ds_cpl vmx smx est tm2 cx16 xtpr lahf_lm
bogomips& && &&&: 5666.05
clflush size& & : 64
cache_alignment : 64
address sizes& &: 36 bits physical, 48 bits virtual
power management:
计算的时候top后这样显示：
现在是非常正常的CPU使用情况啊。
top命令查看的CPU使用，nice有100%。
关于top的使用，请参考：
/wiki/linux+top
真的呀，谢谢谢谢啊，哈哈哈，那照这个进度，我的东西要算很久很久咯？
:hand:灰常感谢:D
你好，方便把你得qq号留给我吗？谢谢
你好，我又有问题了，同样的文件在我自己win的电脑上（一个2G的cpu）计算的时候11个小时就出来了，不过选择并行的时候，也选择的4，因为有4个虚拟的核。但在服务器上并行，4个cpu，每个cpu2个G，都2天多了还没算完，是不是程序（linux下）或软件有问题哦，
Intel的超线程技术对于计算没啥意义。建议关闭。
但是不关的话会影响计算速度吗？
选2CPU试试，反正选4CPU肯定不会快只会更慢。：）
好的，我试一试
我选择两个cpu跑NVT系综动力学，将下面两层，蛋白质和金属表面固定，想将水跑均匀，交上去一会儿提示错误，out文件提示错误为：Discover terminated by signal: SIGSEGV (segmentation violation)，这个不晓得是选择cpu的问题还是我固定得不对哦，下面是我原始结构和固定的结构（固定部分红色显示）
你好，你觉得我这样修改了后，还不能并行的原因是什么呢，能帮我分析一下么，谢谢
未命名.jpg
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