主要是针对单细胞转录组测序数據开发的用来找不同细胞类型或者不同细胞状态的差异表达基因。分析起始是表达矩阵作者推荐用比较老旧的Tophat+Cufflinks流程,或者RSEM, eXpress,Sailfish,等等需要嘚是基于转录本的表达矩阵,我一般用subjunc+featureCounts 来获取表达矩阵
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主要是针对单细胞转录组测序数據开发的用来找不同细胞类型或者不同细胞状态的差异表达基因。分析起始是表达矩阵作者推荐用比较老旧的Tophat+Cufflinks流程,或者RSEM, eXpress,Sailfish,等等需要嘚是基于转录本的表达矩阵,我一般用subjunc+featureCounts 来获取表达矩阵
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