其实并不是每种遗传变异都可达到遗传的阶段。会遗传的变异性状其实并不多。而能决定最终区隔出种的遗传变异，它的发生率也是不多。但是一旦发生就是会制造出不同的物种。物种的形成可先从亚种（subspecies)开始，这也是最近在生态学与演化论中比“种”要更受到关注研究的热区。亚种所造成的体质区隔与发展会使得彼此繁殖成功率越趋降低与各自发展。

达尔文的时代，只注意到渐进的天择与透过竞争所造成的适者生存，但他当时并不承认骤变的大灭绝事件。然而后来越来越多的生物地质学研究发现了大灭绝事件所对生物演化所带来的重大影响。只要有发生大灭绝的趋向，则生物的种类定当大幅锐减。目前的世界已逐渐迈向第六次的大灭绝（因为人类所导致的），但排除人类目前的活动。则地史上至少出现过五次的大灭绝，以及其他规模较小的区域性灭绝事件。这些都是不可不被考虑到的因子。另外，生物也绝非仅只传统进化论当中所强调的竞争关系，有更多的生态互动关系是可能会影响演化历程的，像是共生作用、利他作用等，这类互惠利他的过程也是达尔文当年曾经试图淡化或回避的区块。但它们是有可能减缓物种间对立的关系，并且减慢不必要的性状分化与演化。所以在地球的历史上，并不是每一个阶段生物物种都会大量发生，除非刚刚经历大灭绝之后而形成的生态位大量空缺，例如白垩纪之后哺乳动物大规模的辐射发展，或是地球某一阶段环境上符合生物大发展的条件，例如寒武纪大爆发等。

生物演化有很多偶然性，并不能够用数理上的回推。事实上，即便给予同样的条件与生物，如果将时间回推，也不一定会朝向同样的方向去进化。在很多时候，有点类似物理学上的chaos。有很多非特定的因素会影响演化的路径。