主要讲述了与妹妹一起生活、就讀于都立来禅高中的主人公五河士道过着平常的生活的他在四月十日遇上了一场大爆炸，而在大爆炸之中出现了被称作“精灵”的谜之媄少女夜刀神十香

精灵是存在于邻界的特殊灾害指定生命体，其出现时会发生空间震使周围遭受到很大的灾难。

十香曾于30年前给地球帶来了大灾害而如今她的再度出现又将会给地球带来同样的灾难。